Lluis Quintana-Murci a réalisé ses études de biologie à l’université de Barcelone, son doctorat en génétique des populations à l’université de Pavie (Italie), et son habilitation à diriger des recherches à l'université Pierre-et-Marie-Curie à Paris. Il a intégré le CNRS en 2001, d’abord comme chargé de recherches puis comme directeur de recherches. Il a été directeur scientifique de l’Institut Pasteur en 2016-2017, et visiting professor à l’université Rockefeller (New York, USA) pendant l’été 2018. Depuis 2019, il est titulaire de la chaire Génomique humaine et évolution au Collège de France.